“问题不大。”林晓说，“你在估计偏移量之前，记得先对每个窗口内的标记做一次可靠性筛选。”

“筛选标准可以按MAF和缺失率来做，窗口内标记的MAF中位数低于0.

1的。”

“把低密度区域的低质量标记剔掉，然后再做偏移量估计就ok了。”

不过他也没太过于苛责。

毕竟刘仁华也只是过来帮忙的。

不能以自己的标准来强行要求别人。

毕竟林晓很早之前就清楚一件事。

不要把自己当做别人的标准答案，把别人当成自己的错误选项。

刘仁华听完之后，接着就把这段话在脑子里过了一遍。

“首接跳过该窗口不做校正？”

他奶奶的？

这就完事了？

问题这么快就给我找出来了？

说着，他重新调整了脚本。

在偏移量估计模块前插入了一层筛选逻辑，然后重跑了那几条染色体的数据。

这一回，那几段锯齿状波动果不其然消失了。

曲线恢复了平稳的走势。

刘仁华忽然有些怀疑人生起来了。

不过，真论起来也没那么夸张。

毕竟刘仁华在程海英团队做的是标准化的分析流程。

每一步都有明确的输入和输出定义，很少遇到需要临场调整参数的情况。

林晓刚才说的这个处理方式。

在他的经验里就不属于标准流程。

反而更像是操作者根据数据实际情况临时加的一道预处理。

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